В ротовой полости человека скрываются огромные ДНК-острова: новое открытие о микробиоме
Ученые Токийского университета сделали сенсационное открытие: в слюне человека существуют не просто бактерии, а крупные, самостоятельные фрагменты ДНК – так называемые иноклы. Эти иноклы, содержащие генетический материал, значительно превосходящий по размеру обычные плазмы, были впервые успешно визуализированы и проанализированы.
Команда исследователей использовала передовые методы секвенирования длинных фрагментов ДНК и специальные стратегии для удаления человеческой ДНК из слюнных проб. В результате удалось собрать полные геномы иноклов, относящихся к бактерии *Streptococcus salivarius*. Эти иноклы, достигающие в среднем 350 килобаз, являются одними из крупнейших внехромосомных элементов микробиома человека, значительно превосходя по размеру обычные плазмы.
Ученые выяснили, что иноклы содержат гены, отвечающие за защиту от окислительного стресса, ремонт ДНК и адаптацию к внешним воздействиям. По предварительным оценкам, около 74% населения может быть носителями этих элементов, что открывает новые возможности для понимания роли микробиома в здоровье и болезнях.
Дальнейшие исследования направлены на разработку методов культивирования бактерий с иноклами для изучения их функций, механизмов распространения между людьми и потенциального влияния на различные заболевания, включая кариес и болезни десен. В ходе исследований будут использоваться как лабораторные эксперименты, так и компьютерное моделирование, что позволит глубже понять сложную взаимосвязь между человеком и его микробиомом.
